На базе УЗ "2-я городская детская клиническая больница" функционирует 4 Республиканских центра: Республиканский центр детской урологии, Республиканский центр детской нефрологии и заместительной почечной терапии, Республиканский центр детской эндокринологии и Республиканский центр детской кардиоревматологии.
Оказание своевременной высококвалифицированной специализированной лечебно-диагностической урологической (хирургической), нефрологической, кардиологической, эндокринологической помощи стационарным больным согласно Государственных стандартов обследования и лечения.
В больнице сконцентрировано новое высокотехнологичное оборудование, что позволяет проводить обследование и лечение детей с тяжелой почечной патологией, эндокринными и кардиологическими заболеваниями с использованием современных медицинских технологий.
Все виды лицензированных работ и услуг выполняются также и на платной основе.
В области использования лечебно-диагностического оборудования: ультразвуковая диагностика, мониторинг АД, холтеровское мониторирование ЭКГ, рентгенологическое исследование мочевой системы (экскреторная урография, цистография), желудочно-кишечного тракта (ирригоскопия), эндоскопические исследования (колоноскопия, эзофагогастрофиброскопия с биопсией), нефробиопсия, эндоскопические исследования в урологии, литотрипсия, диализотерапия, уродинамические исследования.