В структуре гимназии функционируют три ступени образования:
- I ступень (1-4 классы) ,
- II ступень (5-9 классы) ,
- III ступень (10-11 классы) физико-математическое направление.
При гимназии работает начальная школа (1-4 классы). Она располагаются как в корпусе 1 (Восточная, 40), так и при детских дошкольных учреждениях. В начальной школе учащиеся получают глубокие знания по основам наук, изучают английский или немецкий язык с 3 класса. Для учащихся начальных классов открыты разнообразные кружки (театр, бальные танцы, вышивка, вязание, керамика, изостудия, вокальные группы, обучение компьютерной грамотности и др.), которые способствуют всестороннему и гармоничному развитию личности учащихся начальной школы.
В 5 – 7 параллели (Восточная, 40) 471 учащихся получают базовый уровень знаний, посещают в соответствии со склонностями и интересами различные факультативные занятия. На этой ступени осуществляется внутренняя дифференциация, разноуровневое обучение. Гимназисты получают первоначальную профессиональную ориентацию и более высокий уровень подготовки по математике, физике, информатике, английскому или немецкому языкам на факультативных занятиях.
В старших классах (8-11 классы; Некрасова, 24) идет освоение теоретических основ наук, подготовка к поступлению в вузы. В 8 – 11 классах ведётся интенсивная подготовка гимназистов по математике, физике, информатике, английскому или немецкому языкам на учебных и факультативных занятиях.
Гимназисты имеют возможность выбора факультативных занятий и кружков. Факультативные занятия, творческие лаборатории, кружки направлены на углубление программного материала, отработку практических навыков. Широко используются возможности кабинетов информационных технологий как при проведении учебных занятий, так и при проведении занятий второй половины дня.
