Средняя школа № 46 открылась в 1969 году. Это была одна из первых школ в микрорайоне Чижовка.
С 2013/2014 учебного года для 10 классов в школе организовано изучение на повышенном уровне учебных предметов: математика и физика.
Школа состоит из двух уровней: уровня общего базового образования и уровня общего среднего образования. базового образования, с учетом начального образования – 9 лет, I – IV, V – IX классы).
